與傳統小分子藥不同，單抗類蛋白藥是非均一性的結構復雜的大分子，因此使這類原研藥或仿制藥的研發與質控工作難度增大。通過液相色譜-質譜聯用技術（LC/MS），結合蛋白分子量的測定、異構體、氨基酸修飾、糖基化修飾以及聚集情況分析等多種檢測手段，可對單抗類藥物進行全面的結構表征。

　　在文獻《Physicochemical and Functional Comparability Between the Proposed Biosimilar Rituximab GP2013 and Originator Rituximab》中提到了將利妥昔單抗與其生物類似藥（GP2013）之間，針對各項物化性質和功能性指標進行了對比分析試驗。

　　利用尺寸排阻色譜法（SEC）的分子空間結構不同的原理可對抗體的多聚體、抗體片段以及PEG蛋白等進行有效分析。在該文獻中，對原研和仿制藥樣品的非均一性分析（抗體聚集情況分析）時使用了TSKgel G3000SWXL色譜柱（請參照該文獻2.12 SEC，CE-SDS，AF4部分）。

　　硼酸鹽親和色譜法多用于對糖或糖蛋白等生物分子進行分離。該文獻中，使用了親和色譜柱TSKgel Boronate-5PW對GP2013樣品中糖基化和未糖基化的抗體異構體進行了分離。（請參照該文獻2.13 Boronate Affinity Chromatography部分）

　　在該文獻2.14 Glycan Analysis部分中，通過N-糖苷酶F來釋放單克隆抗體Fc部分上的糖鏈，并對游離的N-末端糖鏈進行2-AB熒光標記后進行糖基化分析。其中使用到了TSKgel Amide-80（2.0 mm ID X 15 cm，3 um）色譜柱用來分離2-AB標記的糖鏈。

　　TSKgel Amide-80親水相互作用（HILIC）色譜柱適用于親水性低分子、核酸以及糖類等化合物的分離分析。在單抗藥物分析應用上，TSKgel Amide-80常用來分析結合在抗體上的糖鏈的結構差異性。