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中國科學家開發替代Cas9的基因編輯新技術

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關鍵詞:基因編輯,Cas9

    科學家開發替代Cas9的基因編輯新技術

       5月2日,發表在Nature Biotechnology上的這項研究中,河北科技大學以及浙江大學醫學院的研究人員報告稱,Natronobacterium gregoryi Argonaute(NgAgo)是一種DNA導向的可用于人類細胞基因編輯的核酸內切酶。

      RNA導向的核酸內切酶Cas9使得基因編輯成為了一種廣泛應用的技術。然而,盡管科學家們已嘗試多種方式對Cas9系統進行優化以提高它的效率和特異性,但該系統的實用性依然受到了一些因素的限制,包括其對導向-靶向(guide–target)錯配的耐受性以及導向RNA相對容易形成二級結構等。

      類似于Cas9,來自Argonaute蛋白家族的內切酶也可以利用寡核苷酸作為引導,降解侵入性的基因組。Argonautes在基因表達抑制以及抵御外來核酸方面起著關鍵的作用。4月12日,發表在PNAS上的一項研究中,加州大學伯克利分校的研究人員揭示了一種Argonaute非典型的導向RNA特異性,論文的通訊作者是CRISPR先驅之一的Jennifer A. Doudna。

      5月2日,最新發表在Nature Biotechnology上的一項研究中,河北科技大學以及浙江大學醫學院的研究人員報告稱,Natronobacterium gregoryi Argonaute(NgAgo)是一種DNA導向的可用于人類細胞基因編輯的核酸內切酶。NgAgo可結合約24個核苷酸大小的5′磷酸化單鏈導向DNA(guide DNA ,gDNA),有效形成位點特異的DNA雙鏈缺口。

      據悉,CRISPR/Cas9的靶向特異性是由兩部分決定的,一部分是RNA嵌合體和靶DNA之間的堿基配對,另一部分是Cas9蛋白和一個短DNA基序(DNA motif)的結合,這個短DNA基序通常在靶DNA的3‘末端發現,被稱為前間區序列鄰近基序(protospacer adjacent motif,PAM)

      與Cas9不同,NgAgo–gDNA系統不需要PAM,初步鑒定表明,該系統對導向-靶向(guide–target)錯配耐受低,且對編輯富含G+C的基因組更加有效。據介紹,Cas9只存在于原核生物中,而Argonautes幾乎存在于所有的有機體中。

      此外,要想與Cas9正確綁定,導向RNA必須有3′RNA-RNA雜化結構,而與Argonaute綁定不需要導向分子有任何特定的二級結構。另一方面,Cas9只能切割PAM上游的序列,而Argonaute不需要靶標有特定的序列。作者們表示,Natronobacterium gregoryi Argonaute有望成為編輯哺乳動物基因組的精準有效的工具。

    (審核編輯: 滄海一土)

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